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[转贴] 最早的H7N9病毒记录:1988年,来自美国卫生部

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发表于 2013-5-2 18:16:11 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
[paragraph]
最早的H7N9病毒记录:1988年,来自美国卫生部
(2013-04-23 02:06:41)

在网上查到关于H7N9禽流感最早的记录,来自美国卫生部,美国国家生物技术信息中心;时间:1988年,地点:美国明尼苏达州,感染动物:火鸡。科学杂志2006年某刊作为索引文献的15个作者中,6人姓名看起来是中国人。病毒的基因序列也列在文章中。网址如下:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CY014787.1Influenza A virus(A/turkey/Minnesota/1/1988(H7N9)) segment 7, complete sequence

GenBank: CY014787.1
FASTA Graphics




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LOCUS       CY014787                1027 bp    cRNA    linear   VRL 21-SEP-2006
DEFINITION  Influenza A virus (A/turkey/Minnesota/1/1988(H7N9)) segment 7,
            complete sequence.
ACCESSION   CY014787
VERSION     CY014787.1  GI:115278574
KEYWORDS    .
SOURCE      Influenza A virus (A/turkey/Minnesota/1/1988(H7N9))
  ORGANISM  Influenza A virus (A/turkey/Minnesota/1/1988(H7N9))
            Viruses; ssRNA negative-strand viruses; Orthomyxoviridae;
            Influenzavirus A.
REFERENCE   1  (bases 1 to 1027)
  AUTHORS   Obenauer,J.C., Denson,J., Mehta,P.K., Su,X., Mukatira,S.,
            Finkelstein,D.B., Xu,X., Wang,J., Ma,J., Fan,Y., Rakestraw,K.M.,
            Webster,R.G., Hoffmann,E., Krauss,S., Zheng,J., Zhang,Z. and
            Naeve,C.W.
  TITLE     Large-scale sequence analysis of avian influenza isolates
  JOURNAL   Science 311 (5767), 1576-1580 (2006)
   PUBMED   16439620
REFERENCE   2  (bases 1 to 1027)
  AUTHORS   Obenauer,J.C., Denson,J., Mehta,P.K., Su,X., Mukatira,S.,
            Finkelstein,D.B., Xu,X., Wang,J., Ma,J., Fan,Y., Rakestraw,K.M.,
            Webster,R.G., Hoffmann,E., Krauss,S., Zheng,J., Zhang,Z. and
            Naeve,C.W.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (13-SEP-2006) Hartwell Center for Bioinformatics &
            Biotechnology, St. Jude Children's Research Hospital, 332 North
            Lauderdale Str., Memphis, TN 38105, USA
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..1027
                     /organism="Influenza A virus
                     (A/turkey/Minnesota/1/1988(H7N9))"
                     /mol_type="viral cRNA"
                     /strain="A/turkey/Minnesota/1/1988"
                     /serotype="H7N9"
                     /host="Avian"
                     /db_xref="taxon:402490"
                     /segment="7"
                     /country="USA: Minnesota"
                     /collection_date="13-Jul-1988"
     primer_bind     1..15
                     /note="CR amplification primer sequence"
     gene            26..1007
                     /gene="M2"
     CDS             join(26..51,740..1007)
                     /gene="M2"
                     /codon_start=1
                     /product="matrix protein 2"
                     /protein_id="ABI84696.1"
                     /db_xref="GI:115278576"
                     /translation="MSLLTEVETPTRNGWECKCSDSSDPLVIAASIIGILHLILWILD
                     RLFFKCIYRRLKYGLKRGPSTEGVPESMREEYRQEQQSAVDVDDGHFVNIELE"
     gene            26..784
                     /gene="M1"
     CDS             26..784
                     /gene="M1"
                     /codon_start=1
                     /product="matrix protein 1"
                     /protein_id="ABI84695.1"
                     /db_xref="GI:115278575"
                     /translation="MSLLTEVETYVLSIVPSGPLKAEIAQRLEDVFAGKNTDLEALME
                     WLKTRPILSPLTKGILGFVFTLTVPSERGLQRRRFVQNALNGNGDPNNMDRAVKLYRK
                     LKREITFHGAKEVALSYSTGALASCMGLIYNRMGTVTTEVAFGLVCATCEQIADSQHR
                     SHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRT
                     IGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMGVQMQRFK"
     primer_bind     complement(1007..1027)
                     /note="CR amplification primer sequence"
ORIGIN      
        1 agcaaaagca ggtagatatt gaaagatgag tcttctaacc gaggtcgaaa cgtacgttct
       61 ctctatcgtc ccgtcaggcc ccctcaaagc cgagatcgcg cagagacttg aagatgtctt
      121 tgcagggaag aacaccgatc ttgaggcact catggagtgg ctaaagacaa gaccaatcct
      181 gtcacctctg accaagggga ttttaggatt tgtgtttacg ctcaccgtgc ccagtgagcg
      241 aggactgcag cgtagacgct ttgtccaaaa tgcccttaat gggaatgggg atccaaacaa
      301 catggacaga gcagtcaaac tatacaggaa actaaaaagg gaaataacat tccatggggc
      361 aaaagaagta gcactcagtt attcaactgg tgcacttgcc agttgcatgg gcctcatata
      421 caacagaatg gggactgtga ccaccgaagt ggcatttggc ctggtgtgcg ccacatgtga
      481 gcagattgct gattcccagc atcggtctca cagacaaatg gtgacaacaa ccaacccact
      541 aatcagacat gagaacagaa tggtactagc cagtactacg gctaaagcca tggagcaaat
      601 ggcaggatca agtgagcaag cagcagaggc tatggaggtt gctagtcagg ctaggcaaat
      661 ggtgcaggca atgaggacca ttggaactca tcctagctcc agtgctggtc taaaagatga
      721 tcttcttgaa aatttgcagg cctaccagaa acggatggga gtgcaaatgc agcgattcaa
      781 gtgatcctct cgttattgcc gcaagtatca ttgggatctt gcacttgata ttgtggattc
      841 ttgatcgtct tttcttcaaa tgcatttatc gtcgccttaa atacggtttg aaaagagggc
      901 cttctacgga aggagtgcct gagtctatga gggaagaata ccggcaggaa cagcagagtg
      961 ctgtggatgt tgacgatggt cattttgtca acatagagct ggagtaaaaa actaccttgt
     1021 ttctact
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沙发
发表于 2013-8-5 13:53:07 | 只看该作者
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